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随着基因组学和生物信息学的发展,特别是高通量测序技术的广泛应用,大量的非编码RNA(ncRNA)被发现,其中长链非编码RNA(lncRNA)是指一类长度超过200个核苷酸的非编码调控分子。越来越多的证据表明,lncRNAs广泛参与植物生长发育和逆境胁迫等诸多生物学过程。 近日,Vegetable Research在线发表了华北理工大学生命科学学院宋小明课题组题为Research progresson biological functions of lncRNAs in major vegetable crops的综述论文。系统整理和总结了2007年至今在主要蔬菜作物中报道的lncRNA研究进展(图1)。

图1 主要蔬菜作物LncRNA研究文献统计

该研究综述了lncRNA的基本特征以及lncRNA在主要蔬菜作物生长发育(果实的发育和成熟、春化、花粉发育和雄性不育、花青素的生物合成等)、非生物胁迫(干旱、高温、低温等)、生物胁迫以及其他生物学过程中发挥的作用,其中涉及lncRNA与miRNA的互作(图2)。研究系统的分析整理了lncRNA在蔬菜作物中发挥的功能及调控机制,并指出了lncRNA在部分蔬菜作物中的研究相对滞后等问题,同时为在蔬菜作物中深入研究lncRNA的生物学功能提供了建议和展望。

图2 主要蔬菜作物中LncRNA在不同发育或逆境胁迫下调控模型

华北理工大学生命科学学院青年教师李楠和研究生王玉洁为论文共同第一作者,青年教师宋小明为通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金、河北省自然科学基金和中国博士后科学基金等项目的支持。

https://doi.org/10.48130/VR-2022-0014

关于Vegetable Research

Vegetable Research是一本开放获取的期刊,致力于传播蔬菜作物研究进展。欢迎蔬菜研究所有领域的原始研究论文、方法、资源和综述等投稿,主题范围包括(但不限于)遗传、育种、组学、分子生物学、生物技术、与环境和其他生物系统的相互作用以及采收前/后的生产。期刊主编由中国农业大学张小兰教授担任。

期刊官网:

www.maxapress.com/vegres

投稿网址:

mc03.manuscriptcentral.com/vegres

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